MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 95920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013159	GTC	2	6	126	131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054090
2	NC_013159	CAA	2	6	177	182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054090
3	NC_013159	CTG	2	6	216	221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054090
4	NC_013159	CTG	2	6	234	239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054090
5	NC_013159	AGG	2	6	262	267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054090
6	NC_013159	GCC	2	6	428	433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
7	NC_013159	CGA	2	6	439	444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054090
8	NC_013159	CGC	2	6	454	459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
9	NC_013159	CA	3	6	479	484	50 %	0 %	0 %	50 %	257054090
10	NC_013159	CCCTC	2	10	497	506	0 %	20 %	0 %	80 %	257054090
11	NC_013159	ACG	2	6	541	546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054090
12	NC_013159	ATC	2	6	552	557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054090
13	NC_013159	GCC	2	6	572	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
14	NC_013159	TCC	2	6	650	655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054090
15	NC_013159	CCG	2	6	664	669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
16	NC_013159	CCTCC	2	10	692	701	0 %	20 %	0 %	80 %	257054090
17	NC_013159	GAC	2	6	735	740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054090
18	NC_013159	CGA	2	6	746	751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054090
19	NC_013159	GCG	3	9	924	932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054090
20	NC_013159	GTCGCC	2	12	933	944	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257054090
21	NC_013159	G	6	6	982	987	0 %	0 %	100 %	0 %	257054090
22	NC_013159	CGGT	2	8	1021	1028	0 %	25 %	50 %	25 %	257054090
23	NC_013159	GGA	2	6	1079	1084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054090
24	NC_013159	TCA	2	6	1099	1104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054090
25	NC_013159	CT	3	6	1106	1111	0 %	50 %	0 %	50 %	257054090
26	NC_013159	CGA	2	6	1115	1120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054090
27	NC_013159	CGC	2	6	1140	1145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
28	NC_013159	GACATC	2	12	1152	1163	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257054090
29	NC_013159	AAGG	2	8	1197	1204	50 %	0 %	50 %	0 %	257054090
30	NC_013159	AGG	2	6	1210	1215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054090
31	NC_013159	TTC	2	6	1218	1223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054090
32	NC_013159	AACA	2	8	1251	1258	75 %	0 %	0 %	25 %	257054090
33	NC_013159	TCG	2	6	1261	1266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054090
34	NC_013159	TCC	2	6	1269	1274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054090
35	NC_013159	CCG	2	6	1281	1286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
36	NC_013159	GAG	2	6	1305	1310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054090
37	NC_013159	GCC	2	6	1355	1360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
38	NC_013159	GAA	2	6	1391	1396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054090
39	NC_013159	CGC	2	6	1445	1450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054090
40	NC_013159	GC	3	6	1483	1488	0 %	0 %	50 %	50 %	257054090
41	NC_013159	GAT	2	6	1607	1612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054090
42	NC_013159	CGG	2	6	1624	1629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054090
43	NC_013159	TTC	2	6	1632	1637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054090
44	NC_013159	GGA	2	6	1649	1654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054090
45	NC_013159	CCGC	2	8	1690	1697	0 %	0 %	25 %	75 %	257054090
46	NC_013159	ACCAC	2	10	1774	1783	40 %	0 %	0 %	60 %	257054090
47	NC_013159	AAG	2	6	1800	1805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054090
48	NC_013159	GCG	2	6	1826	1831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054090
49	NC_013159	CG	3	6	1880	1885	0 %	0 %	50 %	50 %	257054090
50	NC_013159	GCC	2	6	2833	2838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054091
51	NC_013159	TGG	2	6	2851	2856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054091
52	NC_013159	TCC	2	6	2859	2864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054091
53	NC_013159	GCCC	2	8	3022	3029	0 %	0 %	25 %	75 %	257054091
54	NC_013159	CCA	2	6	3099	3104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054091
55	NC_013159	GCCC	2	8	3130	3137	0 %	0 %	25 %	75 %	257054091
56	NC_013159	GGCG	2	8	3148	3155	0 %	0 %	75 %	25 %	257054091
57	NC_013159	GAC	2	6	3215	3220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054091
58	NC_013159	GCA	2	6	3261	3266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054091
59	NC_013159	TCG	2	6	3276	3281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054091
60	NC_013159	CCG	2	6	3327	3332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054091
61	NC_013159	CGG	2	6	3348	3353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054091
62	NC_013159	CCCG	2	8	3362	3369	0 %	0 %	25 %	75 %	257054091
63	NC_013159	CGC	2	6	3382	3387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054091
64	NC_013159	CCG	2	6	3402	3407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054091
65	NC_013159	ACG	2	6	3410	3415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054091
66	NC_013159	GGCG	2	8	3430	3437	0 %	0 %	75 %	25 %	257054091
67	NC_013159	GGT	2	6	3461	3466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054091
68	NC_013159	CCG	2	6	3506	3511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054091
69	NC_013159	GCT	2	6	3520	3525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054091
70	NC_013159	ACT	2	6	3534	3539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054091
71	NC_013159	CG	4	8	3543	3550	0 %	0 %	50 %	50 %	257054091
72	NC_013159	TCG	2	6	3597	3602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054091
73	NC_013159	TCAGG	2	10	3616	3625	20 %	20 %	40 %	20 %	257054091
74	NC_013159	GGC	2	6	3655	3660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054091
75	NC_013159	GAC	2	6	3668	3673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054091
76	NC_013159	GGA	3	9	3685	3693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054091
77	NC_013159	CCG	2	6	3831	3836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054091
78	NC_013159	AGC	2	6	3901	3906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054091
79	NC_013159	GTG	2	6	4012	4017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054092
80	NC_013159	CGTCG	2	10	4047	4056	0 %	20 %	40 %	40 %	257054092
81	NC_013159	TGG	2	6	4067	4072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054092
82	NC_013159	GTG	2	6	4093	4098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054092
83	NC_013159	CGGC	2	8	4112	4119	0 %	0 %	50 %	50 %	257054092
84	NC_013159	GCG	2	6	4120	4125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054092
85	NC_013159	CGA	2	6	4161	4166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054092
86	NC_013159	GCT	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054092
87	NC_013159	GCC	2	6	4235	4240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054092
88	NC_013159	CGG	2	6	4272	4277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054092
89	NC_013159	GGT	2	6	4315	4320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054092
90	NC_013159	CG	3	6	4339	4344	0 %	0 %	50 %	50 %	257054092
91	NC_013159	CGGG	2	8	4403	4410	0 %	0 %	75 %	25 %	257054092
92	NC_013159	GGA	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054092
93	NC_013159	CGG	2	6	4709	4714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054092
94	NC_013159	CG	3	6	4722	4727	0 %	0 %	50 %	50 %	257054092
95	NC_013159	TGCG	2	8	4760	4767	0 %	25 %	50 %	25 %	257054092
96	NC_013159	CGG	2	6	4791	4796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054092
97	NC_013159	TGG	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054093
98	NC_013159	CG	3	6	5025	5030	0 %	0 %	50 %	50 %	257054093
99	NC_013159	GGT	2	6	5045	5050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054093
100	NC_013159	CCGGG	2	10	5091	5100	0 %	0 %	60 %	40 %	257054093
101	NC_013159	CGCGG	2	10	5121	5130	0 %	0 %	60 %	40 %	257054093
102	NC_013159	ACGTG	2	10	5141	5150	20 %	20 %	40 %	20 %	257054093
103	NC_013159	GTT	2	6	5171	5176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054093
104	NC_013159	GGA	2	6	5183	5188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054093
105	NC_013159	ACG	2	6	5219	5224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054093
106	NC_013159	GAC	2	6	5235	5240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054093
107	NC_013159	TGC	2	6	5296	5301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054093
108	NC_013159	TTG	2	6	5316	5321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054093
109	NC_013159	GAG	2	6	5361	5366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054093
110	NC_013159	ACC	2	6	5407	5412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054093
111	NC_013159	GTT	2	6	5432	5437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054093
112	NC_013159	G	6	6	5546	5551	0 %	0 %	100 %	0 %	257054093
113	NC_013159	AGC	2	6	5602	5607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054093
114	NC_013159	CGT	2	6	5782	5787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054093
115	NC_013159	TGC	2	6	5824	5829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054093
116	NC_013159	GAC	2	6	5835	5840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054093
117	NC_013159	CAG	2	6	5858	5863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054093
118	NC_013159	CGA	2	6	5890	5895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054093
119	NC_013159	CGG	2	6	5917	5922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054093
120	NC_013159	CGA	2	6	5927	5932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054093
121	NC_013159	GGC	2	6	6168	6173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054094
122	NC_013159	CGACGG	2	12	6242	6253	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257054094
123	NC_013159	CGA	2	6	6435	6440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054094
124	NC_013159	CTG	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054094
125	NC_013159	GC	3	6	6500	6505	0 %	0 %	50 %	50 %	257054094
126	NC_013159	AAC	2	6	6589	6594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054094
127	NC_013159	CA	3	6	6633	6638	50 %	0 %	0 %	50 %	257054094
128	NC_013159	TGC	2	6	6647	6652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054094
129	NC_013159	CTG	2	6	6661	6666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054094
130	NC_013159	GAA	2	6	7091	7096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054095
131	NC_013159	TCC	2	6	7113	7118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054095
132	NC_013159	CAC	2	6	7197	7202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054095
133	NC_013159	AGG	2	6	7210	7215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054095
134	NC_013159	CGA	2	6	7232	7237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054095
135	NC_013159	GTT	2	6	7274	7279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054095
136	NC_013159	GGT	2	6	7287	7292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054095
137	NC_013159	CGT	2	6	7298	7303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054095
138	NC_013159	CGA	2	6	7304	7309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054095
139	NC_013159	GGT	2	6	7425	7430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054095
140	NC_013159	CGGCGT	2	12	7436	7447	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257054095
141	NC_013159	GGT	2	6	7451	7456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054095
142	NC_013159	TGG	2	6	7546	7551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054095
143	NC_013159	ACCG	2	8	7563	7570	25 %	0 %	25 %	50 %	257054095
144	NC_013159	CGG	2	6	7647	7652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054095
145	NC_013159	CTT	2	6	7667	7672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054095
146	NC_013159	GACG	2	8	7712	7719	25 %	0 %	50 %	25 %	257054095
147	NC_013159	AGG	2	6	7720	7725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054095
148	NC_013159	GCTCA	2	10	7749	7758	20 %	20 %	20 %	40 %	257054095
149	NC_013159	CTA	3	9	7769	7777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054095
150	NC_013159	GGA	2	6	7790	7795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054095
151	NC_013159	TCGAGG	2	12	7873	7884	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257054095
152	NC_013159	ACG	2	6	7900	7905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054095
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154	NC_013159	AC	4	8	7945	7952	50 %	0 %	0 %	50 %	257054095
155	NC_013159	GAG	2	6	7968	7973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054095
156	NC_013159	CCGCG	2	10	7979	7988	0 %	0 %	40 %	60 %	257054095
157	NC_013159	GTG	2	6	7998	8003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054095
158	NC_013159	GC	3	6	8013	8018	0 %	0 %	50 %	50 %	257054095
159	NC_013159	AAG	2	6	8022	8027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054095
160	NC_013159	GAC	2	6	8061	8066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054095
161	NC_013159	AGACGA	2	12	8128	8139	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	257054095
162	NC_013159	TCGT	2	8	8163	8170	0 %	50 %	25 %	25 %	257054095
163	NC_013159	TGGC	2	8	8190	8197	0 %	25 %	50 %	25 %	257054095
164	NC_013159	TCA	3	9	8233	8241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054095
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166	NC_013159	CG	3	6	8276	8281	0 %	0 %	50 %	50 %	257054095
167	NC_013159	GGT	2	6	8325	8330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054095
168	NC_013159	GAG	2	6	8370	8375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054095
169	NC_013159	TCG	2	6	8389	8394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054095
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262	NC_013159	CTG	2	6	11527	11532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054096
263	NC_013159	AGG	2	6	11576	11581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054096
264	NC_013159	CCGGAA	2	12	11605	11616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054096
265	NC_013159	ACC	2	6	11662	11667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054097
266	NC_013159	ACA	2	6	11670	11675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054097
267	NC_013159	ACC	2	6	11705	11710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054097
268	NC_013159	CCG	2	6	11723	11728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054097
269	NC_013159	CGGCT	2	10	11749	11758	0 %	20 %	40 %	40 %	257054097
270	NC_013159	GC	3	6	11859	11864	0 %	0 %	50 %	50 %	257054097
271	NC_013159	GCC	2	6	11866	11871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054097
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276	NC_013159	TTC	2	6	12125	12130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054097
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280	NC_013159	ACG	2	6	12225	12230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054097
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283	NC_013159	TCG	2	6	12285	12290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054097
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285	NC_013159	CGAG	2	8	12391	12398	25 %	0 %	50 %	25 %	257054097
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288	NC_013159	CGA	2	6	12880	12885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054098
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302	NC_013159	CGC	2	6	13408	13413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054098
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371	NC_013159	CG	3	6	17738	17743	0 %	0 %	50 %	50 %	257054105
372	NC_013159	GAT	3	9	17786	17794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054105
373	NC_013159	GTC	3	9	17877	17885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054105
374	NC_013159	TTC	2	6	17888	17893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054105
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378	NC_013159	GCCA	2	8	17973	17980	25 %	0 %	25 %	50 %	257054105
379	NC_013159	CGTC	2	8	17981	17988	0 %	25 %	25 %	50 %	257054105
380	NC_013159	AGTA	2	8	18072	18079	50 %	25 %	25 %	0 %	257054105
381	NC_013159	CGA	2	6	18094	18099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054105
382	NC_013159	GCA	2	6	18115	18120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054105
383	NC_013159	TCG	2	6	18146	18151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054105
384	NC_013159	CGC	2	6	18152	18157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054105
385	NC_013159	ACA	2	6	18199	18204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054105
386	NC_013159	AGC	2	6	18234	18239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054105
387	NC_013159	CGA	2	6	18247	18252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054105
388	NC_013159	GCG	2	6	18277	18282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054105
389	NC_013159	ACCC	2	8	18285	18292	25 %	0 %	0 %	75 %	257054105
390	NC_013159	CCG	2	6	18301	18306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054105
391	NC_013159	ACC	2	6	18389	18394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054105
392	NC_013159	GGA	2	6	18404	18409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054105
393	NC_013159	CGTAC	2	10	18650	18659	20 %	20 %	20 %	40 %	257054106
394	NC_013159	GTT	2	6	18699	18704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054106
395	NC_013159	CG	3	6	18742	18747	0 %	0 %	50 %	50 %	257054106
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398	NC_013159	GTT	2	6	18857	18862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054106
399	NC_013159	CGT	2	6	18883	18888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054106
400	NC_013159	CGG	2	6	18893	18898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054106
401	NC_013159	CCG	2	6	18923	18928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054106
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403	NC_013159	GTC	3	9	19014	19022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054106
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410	NC_013159	GAC	2	6	19257	19262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054106
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420	NC_013159	GGCG	2	8	19540	19547	0 %	0 %	75 %	25 %	257054107
421	NC_013159	GCC	2	6	19593	19598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054107
422	NC_013159	CGGTGC	2	12	19615	19626	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257054107
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424	NC_013159	TCG	2	6	19665	19670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054107
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497	NC_013159	TCGC	2	8	23565	23572	0 %	25 %	25 %	50 %	257054111
498	NC_013159	CGT	2	6	23608	23613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054111
499	NC_013159	GC	3	6	23635	23640	0 %	0 %	50 %	50 %	257054111
500	NC_013159	GTG	2	6	23723	23728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054112

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